香港出口印尼办理印尼FORME原产地证（Form E）的流程主要包括以下几个步骤：

准备材料：收集并准备所有必要的文件，如出口货物的商业发票、装箱单、运输单据等。

提交申请：将准备好的材料提交至中国国际贸易促进委员会（贸促会）或其分支机构，或通过官方在线平台进行在线申请。

审核与核实：相关部门将对提交的材料进行审核和核实，确保信息的真实性和准确性。

缴纳费用：根据规定缴纳相应的申请费用。

领取证书：审核通过后，可以前往指定地点领取FORME原产地证，或通过邮寄方式获取。

办理印尼FORME原产地证所需的主要材料包括：

出口企业的营业执照副本

出口货物的商业发票

出口货物的装箱单

出口货物的运输单据（如海运提单、空运提单等）

其他可能需要的文件，如产品说明书、技术规格书等

如果香港公司以离岸公司或香港抬头出口货物，可以在FORME原产地证的第十三栏勾选第三方发票，并在产地证品名下面的货描处显示香港抬头。同时，提单、箱单等其他文件可以使用香港公司的抬头。

香港公司不能直接向大陆申请办理印尼FORME原产地证，但可以通过代理来办理。代理公司会负责准备材料、提交申请以及后续的审核和领证流程。通过代理办理可以节省时间和精力，确保证书的及时获取。

通常情况下，办理印尼FORME原产地证的时间为1-2个工作日，但具体时间可能因材料准备、审核进度等因素而有所不同。为了确保及时获取证书，建议提前规划并准备相关材料。